ההוראה המותאמת פועלת במערכת החינוך למעלה משני עשורים. ראשיתה בפרויקט ניסויי ניל"י - ניסוי למידה יחידנית - שהתבצע בשיתוף המרכז לטכנולוגיה חינוכית (מטח), בית-הספר לחינוך באוניברסיטת תל-אביב ומשרד החינוך והתרבות (1980-1975). המשכהבפרויקט ההוראה היחידנית שהרחיב את פעולותיו לבתי-ספר רבים ברחבי הארץ באמצעות צוותי פיתוח והפעלה במרכז לטכנולוגיה חינוכית.
בשלהי שנות השמונים, בעקבות פרשנויות מוטעות של המושג "הוראה יחידנית", שלא עלו בקנה אחד עם הכוונות והמטרות של מובילי הרעיון במטח ובאוניברסיטת תל-אביב, שונה שמה של ה'הרואה היחידנית' ל'הוראה מותאמת'.
היום, ההוראה המותאמת היא אחת החלופות החינוכיות המופעלות בבתי-ספר רבים בישובים שונים בארץ
